CICC作为国家级菌种保藏中心，与国际知名质控菌株生产企业建立了战略合作关系，依据《GB 4789食品安全国家标准 食品微生物学检验》系列标准要求，收集、整理了一套即用型质控菌株，以满足不同检测实验室对质控菌株的需求。
| 中文名称 | 标准推荐编号 | 定性质控菌株 | 定量质控菌株 |
|---|---|---|---|
| 大肠埃希氏菌 | ATCC25922 | 0335P | 0335C |
| 粪肠球菌 | ATCC29212 | 0366P | 0366Z |
| 副溶血性弧菌 | ATC17802 | 0818P | / |
| 创伤弧菌 | ATCC27562 | 01076P | / |
| 金黄色葡萄球菌 | ATCC6538 | 0485P | 0485Z |
| 0485-PEC | |||
| 0485FPC | |||
| 枯草芽孢杆菌 | ATCC6633 | 0486P | 0486Z |
| 0486-PEC | |||
| 56143 | |||
| 单核细胞增生李斯特氏菌 | ATCC19115 | 0687P | 0687Z |
| 0687FPC | |||
| 鼠伤寒沙门氏菌 | ATCC14028 | 0363P | 0363Z |
| 阪崎肠杆菌 | ATCC29544 | 01088P | / |
| 大肠埃希氏菌O157：H7 | NCTC12900 | 0861P | / |
| 英诺克李斯特氏菌 | ATCC33090 | 0814P | / |
| 产气肠杆菌 | ATCC13048 | 0306P | 0306Z |
| 0306FPC | |||
| 空肠弯曲菌 | ATCC33291 | 0481P | / |
| 弗氏柠檬酸杆菌 | ATCC43864 | 0229P | / |
| 巴西曲霉 | ATCC16404 | 0392P | 0392Z |
| 0392FPC | |||
| 410106 | |||
| 产气荚膜梭菌 | ATCC13124 | 0318P | 0318Z |
| 艰难梭菌 | ATCC43593 | 0833P | / |
| 铜绿假单胞菌 | ATCC27853 | 0353P | 0353Z |
| 结肠弯曲菌 | ATCC43478 | 0121P | / |
| 铜绿假单胞菌 | ATCC9027 | 0484P | 0484Z |
| 0484PEC | |||
| 56144 | |||
| 酿酒酵母 | ATCC9763 | 0699P | 0699A |
| 金黄色葡萄球菌 | ATCC25923 | 0360P | 0360Z |
| 0360FPC |
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