开发脉冲场凝胶电泳PFGE、随机扩增DNA多态性RAPD、全自动DNA指纹图谱鉴定溯源系统Riboprinter、基于高通量基因测序技术的ANI、SNP分析方法，综合形态学、生理生化、分子生物学等方法，实现微生物种与株水平的精准鉴定。

调研分析国际和国内公认的耐药基因、毒力基因和致病基因数据库，搭建基于全基因组序列比对的微生物菌种基因安全性分析平台，建立微生物基因安全性评价技术体系，识别传统发酵食品微生物菌种的潜在安全性风险因素。

建立可培养法、宏基因组分箱分析、PMA-特异性PCR、RT-特异性PCR技术体系，开展复合微生物活菌计数技术研究，实现复合微生物菌剂、产品、环境样品等的活体微生物靶向定量检测。

课题项目

1.微生物饲料添加剂菌株安全性评价指南制定（主持） 农业农村部畜牧兽医局（16200047）2020年4月-2020年12月

2.饲用微生物及发酵制品生产菌株鉴定与安全性评价专题研究（主持） 全国畜牧总站（XMZZ162019344）2019年12月-2020年3月

3.国家食源性致病微生物全基因组数据库及溯源网络建设（主要参加） “十三五”国家重点研发计划-国家食源性致病微生物全基因组数据库及溯源网络建设（2018YFC1603800）2018年12月-2021年12月

4.微生物全基因组核酸测序技术用于药品质量控制指导原则的建立（主要参加） 国家药典委员会（2018Y008）2018年8月-2020年2月

5.我国优势传统食品产业菌种鉴定评价技术和安全管理体系（主要参加） “十一五”国家科技支撑计划（2007BAK36B06）2007年8月-2010年12月

6.复合益生菌产品菌种/株的精确定量技术开发及应用（主持） 汤臣倍健营养科学研究基金2020年1月-2021年6月

7.专属菌株株水平鉴定研究（主持） 内蒙古乳业技术研究院有限责任公司（HXHT-2019110）2019年11月-2020年8月

8.大肠埃希氏菌透射电镜（负染）方法建立及验证研究（主持） 甘李药业股份有限公司（HXHT-2020002）2019年12月-2020年6月

9.人用基因治疗制品生产菌株鉴定与评价（主持） 江苏金斯瑞生物科技有限公司（HXHT-2019152）2019年11月-2020年1月

10.酵母菌菌种鉴定分析与冻干管加工（主持） 北京生物制品研究所有限责任公司2017年11月-2018年2月

11.双胎妊娠体重差异两胎儿肠道微生态宏基因组测序及分析（主持） 北京大学第三医院  2017年11月-2018年11月

发明专利

1.ZL201410695745.4一种酯酶及其编码基因和其应用 第三发明人，2017年10月10日

2.ZL201410695438.6一种脂肪酶及其编码基因和其应用 第三发明人，2017年6月16日

3.ZL201310667412.6一种快速鉴别中间型高温放线菌的特异PCR方法 第三发明人，2015年8月5日

4.ZL201210506713.6一种冬虫夏草原草粉的双重PCR鉴真方法 第四发明人，2014年6月18日