全基因组测序是指对生物体基因组序列的测定过程。全基因组测序能够全面、精确分析生物体基因组中的碱基组成，揭示基因组的复杂性和多样性。自1987年第一台商用自动测序仪诞生至今，测序技术迅速发展，测序成本不断下降，微生物全基因组测序技术已成为分子生物学实验室越来越广泛使用的技术之一。与传统的微生物鉴定方法相比，全基因组测序技术具有无可比拟的优势，成为当前生物学研究中前沿且极具发展潜力的技术。WGS已相继进入食品、药品、饲料等领域新出台的法规和指南中，为微生物的系统分类、菌株分型、功能挖掘及安全性评价提供重要方法。CICC建立了包括提取基因组DNA、制备文库、DNA测序、生物信息学分析等在内的一套标准化操作程序，可实现对微生物全基因组序列的快速、准确测定。
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